Enzymes Industrielles : sélection de microorganismes pour la biocatalyse

Nous cherchons à développer des systèmes microfluidiques en goutte qui permettent le criblage très haut-débit de plusieurs activités enzymatiques ayant un intérêt industriel.

De tels outils seraient d’un grand intérêt dans le domaine en pleine expansion de la biotechnologie industrielle (aussi connue sous le nom de Biotechnologie Blanche en Europe).

Nous menons plusieurs projets dans lesquels des bactéries sont encapsulées dans des gouttes, avec un système de dosage fluorogénique. Les gouttes sont ensuite triées en fonction de leur fluorescence, en utilisant la diélectrophorèse avec une fréquence de plus d’un millier de gouttes à la seconde, permettant le criblage d’une librairie de plus de 10 millions de clones par jour.

Des tests fluorogéniques pertinents (en particulier des substrats modifiés chimiquement) sont conçus et optimisés pour les activités ciblées.

Avec cette approche nous pouvons cribler :

  • des librairies contenant des mutations aléatoires d’une séquence de souche sauvage, pour chercher des variants dont l’activités est plus élevée ou légèrement différente (e.g profil de pH)
  • des librairies metagénomiques cloné dans E.Coli pour découvrir de nouveaux gènes codant une activité ciblée.

Un de ces projets est en collbaoration avec l’entreprise Soufflet

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